(一）办公室。负责机关日常运转，承担文电、会务、信息、机要、保密、督查、档案、信访、政务公开、部门预算管理、财务管理、资产管理、审计和后勤保障等工作。

(二）组织人事科。承担机关和所属单位的干部人事、机构编制、教育培训等工作。负责组织建设、党风廉政建设、精神文明建设以及宣传、人才、工青妇、统战、离退休干部等工作。

(三）综合规划科。配合编制经济发展规划。组织开展课题调研工作。推进经济体制改革。促进贸易型总部的发展。负责商业领域经济运行监测分析。促进平台经济发展。负责用地（商业、办公用地等）产业征询和规划调整。承担重要文稿起草工作。

(四）服务业指导科。推进服务业发展，重点做好专业服务业和生活服务业发展工作。推进电子商务发展工作。会同相关部门推进服务业综合改革工作。

(五）品牌建设科。负责推进区域品牌经济建设。做好商业品牌培育和引进工作。推进商圈、特色商业街建设。组织商业论坛及商业研讨活动。配合做好新建商业项目招商工作。

(六）商贸管理科。承担推进商贸业发展工作，推进新型商业业态建设。编制商业网点布局规划并组织实施。组织开展商业营销活动，牵头推进商旅文体联动。推进商业载体改造和业态调整工作，做好商业企业服务工作。配合做好商业领域节能降碳工作。

(七）市场运行科（粮食和物资储备科)。负责促进食品流通产业发展。负责粮食和重要物资储备管理与市场调控工作。做好粮油和农副产品保供稳价及重要商品流通追溯等工作。

(八）市场秩序科。牵头推动商务领域安全生产、社会综合治理工作。推进区内商品交易市场转型发展。负责商业预付卡信息对接及监管工作。负责推进再生资源回收行业与生活垃圾清运体系“两网合一”建设。配合做好重大事件应急工作。

(九）外资促进科。推进涉外经济和总部经济发展，承担外资企业和跨国公司地区总部引进工作及相关政策支持。做好外资企业服务、监管及运行分析工作。牵头开展外资企业事中事后监管工作。促进区域涉外营商环境改善和投资便利化建设。

(十）外经贸发展科。促进货物贸易、服务贸易发展，促进贸易便利化建设。推进对外经济合作和国内企业开拓国际市场工作。组织开展外贸扶持资金申报。做好外贸展会和进博会相关工作。负责商务外事工作。