受案范围不同    
    《上海市事业单位聘用合同争议处理办法》适用本市行政区域内建立聘用合同关系的事业单位与受聘人员，因聘用合同发生的争议及其处理。包括受聘人员与聘用单位对公开招聘、聘用程序、定期或者聘期考核、解聘辞聘、未聘人员安置等问题发生的人事争议；国家机关与工作人员之间因录用、调动发生的人事争议；事业单位与工作人员之间因辞职、辞退发生的争议；按照国家和本市有关规定可以仲裁的其他人事争议。人事争议仲裁委员会受理人事争议案件，必须严格按照法规的规定执行，避免随意性。市级事业单位和中央、外省市在本市的事业单位与聘用人员发生的聘用合同争议，由市仲裁委管辖。区（县）级事业单位与聘用人员发生的聘用合同争议，由所在区（县）仲裁委管辖。市仲裁委管辖的简单聘用合同争议，可以委托事业单位所在的区（县）仲裁委处理。由区（县）仲裁委管辖的重大、复杂的聘用合同争议，可以移送市仲裁委处理。
    而劳动争议适用在本市行政区域内的企业、个体经济组织，以及国家机关、事业单位、社会团体等用人单位（以下统称用人单位）与劳动者建立或者形成劳动合同关系的，适用本该《办法》。受理的劳动争议内容包括因企业开除、除名、辞退职工和职工辞职、自动离职发生的劳动争议；因执行国家有关工资、保险、福利、培训、劳动保护的规定发生的争议；因履行劳动合同发生的争议；因认定无效劳动合同、特定条件下订立劳动合同、职工流动、用人单位裁减人员、经济补偿和赔偿发生的劳动争议；法律、法规规定应当处理的其他劳动争议。    
    争议的时效不同    
    人事争议仲裁办法中多处提到时效问题，其中最重要的时效包括当事人应当在人事争议发生之日起６０日内，以书面形式向有管辖权的人事争议仲裁委员会提出申请，逾期再申请的，仲裁委员会可以不予受理。当事人提出仲裁申请时。受理机构必须在１５天内作出受理或不受理的书面决定并通知本人。仲裁庭处理人事争议案件，从仲裁庭组成之日起６０日内结案，特殊情况经仲裁委员会批准可以延期３０日。以往发生人事争议时，通过信访解决，一般需要半年或者一年的时间才能解决。劳动争议仲裁的相关条例规定，劳动争议发生后当事人应当从知道或应当知道其权利被侵害之日起，开始计算申请时效。